據市物流辦發布的數據顯示，2006年，深圳機場貨運量進入世界機場貨運50強。“機場航空物流園的活躍，很大程度上得益于服務模式的創新。”業內人士指出，近年來，航空物流園攜手深圳海關、檢驗檢疫部門，創新了許多監管模式，取得了明顯成效。
　　通關貨物周轉站實現新型監管模式深圳海關在我國現行的五大監管模式的基礎上，引用了物流園雛形——卡車周轉站的原始概念，創立了具有航空貨運特點，同時又融入保稅功能的一種新的監管模式。
　　據機場航空物流園相關負責人介紹，空港通關貨物周轉站是深圳機場航空口岸內設立的用于存放未辦結海關手續的進出口貨物的海關監管倉庫區，入園企業在站內可以辦理進出口貨物倉儲、分撥、中轉、打板等物流業務。
　　據悉，通關貨物周轉站既有進口保稅功能，同時還具有出口監管功能，是深圳航空物流園未來開展“B型保稅物流中心”的嘗試。
　　空港物流快線實現快速通關空港物流快線是由海關策劃實施的深港兩地之間新型的快速物流通道。
　　“空港物流快線可以說是CEPA的產物，也是落實9＋2大通關的舉措，更是快速通關、快速驗放的直接嘗試。”機場航空物流園相關負責人表示，空港物流快線自2005年8月16日試運行以來，效果明顯。
　　據介紹，空港物流快線推出后，凡進出深圳機場、香港兩地的車輛，在GPS和電子關鎖監控下，可快速通過皇崗口岸，在深圳機場一次性辦理通關手續。與此同時，空港物流快線還借助空運艙單系統和空港信息平臺系統實現了監控手段的變革和發展。
　　創新海關監管手段利用現代信息技術創新海關監管手段是提高通關效率的最為有力的保障，為此，深圳機場在海關的幫助下，共同開發了深圳機場空港信息平臺（CISS系統）。通過該系統，海關可及時掌握入園貨物的收、發、存動態，并實現園內實物監管的信息化。
　　據了解，CISS系統主要功能是建立進出周轉站貨物真實、完整的電子底帳，實時采集和傳輸貨物電子數據信息，實現完整的艙單信息、報關信息與企業貨物電子底帳信息交換與管理功能，以滿足海關稽核、統計及核銷監管要求。
　　該信息平臺（CISS系統）在通過深圳市政府全面評審后，于2005年3月28日正式啟用，成為深圳市首批獲政府認定的物流信息平臺，同時也是深圳機場海關對進出周轉站貨物電子信息實施具體監管的輔助監管的唯一信息系統。
　　不斷擴大通關業務類型深圳海關在模式、手段創新的基礎上，還不斷推出新的通關業務類型。目前，深圳航空物流園可開展的通關業務類型已達15種，是有關物流園的3~4倍。