目前，我國醫藥冷鏈物流最突出的問題有兩個方面：一是除了制藥企業發運以外，大量冷藏品在商業環節缺乏有效的冷鏈運輸條件。許多企業托運冷藏品，一旦涉及到多家物流公司之間的分駁作業，藥品在托運終端就很難再保證冷藏運輸條件。尤其是在冷藏品退貨環節，即逆向物流階段，冷藏條件幾乎完全喪失，這可能帶來嚴重的藥品質量問題；二是我國醫藥公司普遍采取的小批量、多批次的發運方式，決定了其很難實現冷藏品的規模集運，這也給選擇物流公司帶來了難題。
我國醫藥企業最頭疼的一個物流管理問題就是冷藏品不好運輸和托運。尤其是一些物流市場不發達的二線城市，社會物流企業普遍不具備冷藏品運輸的條件，因此許多醫藥企業明確規定：冷藏品不得托運。這也體現出我國冷鏈物流落后制約我國醫藥配送業務發展的弊端。
冷鏈物流路崎嶇
在國外，許多制造、商業企業選擇了冷鏈物流外包，將冷藏品的全程運輸、配送業務外包給專業的物流企業，省時省成本，已經成為了一種普遍的選擇。
但是，國內大多數食品、醫藥等冷鏈需求方寧愿出重資自營物流體系，也不愿意、不放心外包給第三方物流企業。不光醫藥行業如此，即使我國發展相對成熟的乳制品、冰淇淋等行業，制造企業選擇冷鏈物流外包的比重都不高。筆者分析，這主要有以下原因：
首先，冷鏈物流的整體投資跟普通貨運相比，普遍要高。普通貨運車上牌照最低10萬元出頭，但是冷藏車僅上牌照一項，平均單車成本至少要高2～3萬元。因此目前國內專業的冷鏈物流服務商本身就不多，外包可選擇的對象較少。
其次，有些特殊行業，如醫藥流通業，有不少藥品如人血制品等屬于需要冷鏈物流特色儲運條件的。但是長期以來，這些行業的冷藏品運輸呈現多批次、小批量的特點，普通貨運企業承接該種冷藏品托運業務是收不抵支。因此在這些行業，除了廠家發貨以外，商業流通環節的冷藏品托運量并不大，許多醫藥公司自己就配有少量的冷藏車、冷藏包。
尤其是目前，制造企業考察第三方物流企業的重點，主要還是其物流網絡是否健全，風險防范機制是否健全，價格是否優惠，而對配送工具的選擇，主要以合同約定的方式進行。而國內專業的冷鏈物流企業本身就不多，可選擇面實在太少。在上述背景下，中國醫藥冷鏈物流之路更是崎嶇。
尚存瓶頸
目前，我國醫藥冷鏈物流最突出的問題有兩個方面：一是除了制藥企業發運以外，大量冷藏品在商業環節缺乏有效的冷鏈運輸條件。許多企業托運冷藏品，一旦涉及到多家物流公司之間的分駁作業，藥品在托運終端就很難再保證冷藏運輸條件。尤其是在冷藏品退貨環節，即逆向物流階段，冷藏條件幾乎完全喪失，這可能帶來嚴重的藥品質量問題；二是我國醫藥公司普遍采取的小批量、多批次的發運方式，決定了其很難實現冷藏品的規模集運，這也給選擇物流公司帶來了難題。
筆者認為，造成上述現象的原因有多種，但是最大的瓶頸還是市場因素導致了醫藥企業集運難度太大，而具備多批次、小批量冷藏品運輸條件的社會物流企業太少。
尤為關鍵的是，國內缺乏強制性的冷藏品運輸法規和地方冷藏品集運中心，因此造成了現在的問題難以解決。