隨著重慶市公路、鐵路、水路和航空的硬件水平的顯著提高，港口、航道及船舶的現代化水平都有大幅提升。今年1-6月，全市完成水路貨運量6310.9萬噸,同比增長11.9%;貨運周轉量825.5億噸公里，同比增長13.6%;港口貨物吞吐量6526.6萬噸，同比增長9.9%。 
　　
　　“十二五”期，在西部大開發戰略深入實施的大背景下，重慶進一步加快建設長江上游綜合交通樞紐，加快推進現代物流體系建設，取得了顯著成效。 
　　
　　培育龍頭企業提升行業“硬實力” 
　　
　　基于構建長江上游地區綜合交通樞紐、加快重慶現代物流業的發展需要，重慶市委、市政府早在2006年就將重慶港務(集團)有限公司、重慶物資(集團)有限公司、重慶市萬州港口(集團)有限公司、涪陵港務管理局的國有資產進行整合，組建了市屬重點國有港口物流企業——重慶港務物流集團有限公司。 
　　
　　整合后，公司的資源配置得到優化，整體競爭實力明顯提升。其主要從事的港口、航運、商貿物流及其延伸服務業務，資產總額達80億元。旗下的重慶港九股份有限公司是我國長江內河首家公開發行股票并在上交所上市交易的港口企業。重慶港盛船務有限公司是目前長江上游綜合運能最大的航運企業，寸灘港區是我國首家內陸保稅港區的“水港”。集團現擁有集裝箱、重件、化工、散貨、滾裝等各種碼頭泊位181個，港口貨物年設計吞吐能力2667萬噸、集裝箱年設計吞吐能力113.5萬TEU、商品車滾裝年設計通過能力30萬輛、重滾年設計通過能力6萬輛。 
　　
　　目前，重慶港務物流集團已經成為重慶航運中心、物流中心、商貿中心、保稅港區和臨港產業重要的支撐企業，在重慶100強企業中排名第23位，是我國西部地區最大的內河主樞紐港、集裝箱吞吐港企業，是重慶市目前唯一的5A級現代綜合物流企業。 
　　
　　除此之外，重慶交運集團、長安民生集團等一批發展中的物流企業也在為重慶現代物流體系建設添磚加瓦。
　　
　　依托保稅港區大力發展保稅物流 
　　
　　2008年11月12日重慶兩路寸灘保稅港區經國務院批準設立，重慶保稅港區成為我國內陸首個保稅港區，也是中國唯一一個擁有“水港+空港”的一區雙核模式保稅港區。重慶保稅港區依托“一區雙功能”獨特優勢，憑借兩江新區先行先試權，通過政策創新和功能拓展，集聚國際國內人才流、物流、資金流、信息流，將成為輻射長江上游地區、西部地區和內陸地區重要的保稅生產加工基地、外貿物流樞紐中心、國際特色商品展示交易中心和進出口貨物集散口岸。 
　　
　　位于重慶市沙坪壩區的重慶西永綜合保稅區，規劃面積10.3平方公里，是我國規劃面積最大的綜合保稅區，也將成為重慶打造內陸開放高地的重要平臺，助推重慶建成中西部第一大加工貿易基地。西永綜合保稅區未來將形成1000多億美元的進出口規模，對國際中轉、配送、采購、轉口貿易和出口加工等業務需求巨大。它與兩路寸灘保稅港區一起，構建起了重慶水陸空保稅的“雙子星座”。 
　　
　　依托兩大保稅港區，重慶大力發展保稅物流。充分發揮保稅物流倉儲的優勢，實現境外進入庫內的貨物給予保稅，境內貨物進入庫內視同出口離境，入保稅庫內即可退稅，貨物在庫內可保稅存放，自由組配和轉移，可暫時免繳納或緩繳納進口稅款，免提交進口許可證或其他進口批文。保稅物流以其獨有的優勢，在未來必將為重慶乃至西部經濟的發展推波助瀾。
　　
　　促進配套布局引導交易市場積聚 
　　
　　隨著重慶城市建設的發展，城市中心的交通壓力日益增大，大型批發市場繼續留中心城區已經不適應城市發展的需要。而城郊的物流樞紐和產業園區能夠為批發市場提供更加便捷的交通及配套服務，因此批發市場的外遷勢在必行。 
　　
　　位于重慶市渝中區核心區域的重慶朝天門批發市場是中國十大批發市場之一，也是長江上游最大的日用工業品批發市場。然而，近年來隨著渝中區城市規劃建設的逐步推進，批發市場周邊的被定位成更加高端的商業區，同時，市場賴以生存的水路交通，也因為主城區貨運碼頭的逐漸外遷而失去。因此市場的搬遷也就成為了必然之選。 
　　
　　據了解，新建的朝天門國際商貿城選址在較為偏遠的南岸區迎龍，與舊市場相比，新市場在建筑面積、配套服務設施、交通條件等方面均有大幅度提升。舊市場面積約61萬平方米，商鋪總量為1.6萬余個，而新市場總建筑面積超過300萬平方米，商鋪總量將達到3萬個。重慶市計劃將其打造成立足大重慶、輻射中西部的商品進出口集散地、長江上游地區的商貿物流中心。